非洲猪瘟病毒为DNA病毒，是非洲猪瘟病毒科、非洲猪瘟病毒属的成员，DNA大，非常复杂，编码160多种蛋白，其中半数以上蛋白的功能还不清楚。

1、非洲猪瘟病毒的免疫原性很差，自然感染的病毒也很难诱导抗体的产生，据调查，仅有2%的感染猪可以检测到抗体（也可能与检测方法有关）。我国的科研人员对非洲猪瘟病毒本身的研究较少，还有很多未知的东西。

2、病毒更容易变异，病毒基因组复杂，在复制过程中容易出错，所以变异的频率较高，因此，即使有疫苗，对变异毒株的交叉保护很差。

3、 由于可能有细胞免疫起作用，灭活苗很难激发细胞免疫，因此其效果较差。

4、活苗，不管是自然弱毒还是人工致弱，风险很大，可能有一定的致病力，如果贸然推出，有可能造成灾难性后果。再者，非洲猪瘟病毒的主要免疫原性蛋白尚没有完全搞清楚，就很难制作基因工程疫苗或亚单位疫苗，即使勉强制作出来，也难以奏效。