回到家禽和禽舍管理的基础是克服球虫病和其他影响使用养殖（NAE）体系的生产者的健康问题的关键。
奥本大学家禽科学教授Joseph Giambrone博士说，球虫病导致坏死性肠炎（NE）一直是使用NAE生产系统的生产者面临的一个主要问题。然而，确定在营养、生物安全和垫料质量方面的改进意味着该行业能够在应对这些疾病方面取得重大进展。他说：“基本的健康管理和生物安全都有很长的路要走”。Giambrone在接受《Poultry Health Today》采访时表示，许多生产者已经迈出了重要的一步，认识到坏死性肠炎不仅继发于球虫病，而且还与其他可能刺激肠道的问题有关，如饲料膳食纤维和饲料颗粒大小。这促使该行业的许多人考虑通过减少在饲料中使用（DDGS）、添加更好的酶来消化纤维，以及在孵化场为家禽接种球虫病疫苗来改善家禽的饲料。
他说：“其他人也在考虑更好的生物安全等问题。这些措施包括穿上防护鞋，控制害虫，通过使用更干燥的垫料来减少垫料中的病原微生物，更好地控制空气，以及更好地处理饲料和饮水。”
“这很复杂，不同农场的情况不同，这就是为什么在某些情况下人们使用益生菌和益生元，有时有效，有时无效，所以它必须量身定制，就像免疫程序一样。”Giambrone说，正确使用无抗养殖体系的最大管理领域之一是垫料质量。“梭状芽孢杆菌是坏死性肠炎的主要病原，但也有梭状芽孢杆菌可以导致坏疽性皮炎。鸡场也有大肠杆菌，可以是肠道疾病或败血症。很多这样的病变最终会在加工厂被废弃。”他补充说，还有一些对公众健康至关重要的潜在问题，比如沙门氏菌和弯曲杆菌，需要加以考虑。“虽然它们在家禽中不引起疾病问题，但可能会出现在受污染的胴体和鸡蛋中，如果消费者没有正确处理它们，那么最终会出现食品安全问题。”Giambrone说，随着越来越多的消费者选择无抗养殖的产品，这些挑战将会持续存在，所以在农场学习应对这些感染的方法至关重要。“最初被禁用的抗生素是促生长类抗生素……但它们也控制了坏死性肠炎……所以当这些抗生素被禁用时，后果是这些疾病增加。”
