洪水过后，疾病发生的风险就加大了，尤其是非洲猪瘟，目前已有很多地方的猪场发生了非洲猪瘟，显然与洪水有直接关系。非洲猪瘟病毒污染水源后，其传播的速度和程度比污染饲料的程度更高，特别是那些以前发生过非洲猪瘟并在猪场附近或场内掩埋的猪场，洪水可能使原本掩盖（隐藏）的病毒显露出来，或者将猪场周边道路、路边的病毒冲入猪场。病毒可以随着洪水传遍整个猪场。

除了病毒之外，洪水还造成了猪的极大应激，造成了猪抵抗力的降低，更容易发病。此外，湿度加大，饲料霉变可能性加大，也会降低猪体抵抗力。由于洪水，进水猪舍的猪向没有进水的猪舍转移，造成猪群密度升高，也可加快传播。

在正常检测的猪场，由于洪水的影响，可能中断了检测程序，或者延误了检测，不利清除感染者，就不能清除传染源和切断传播途径。

猪丹毒是严重危害养猪业发展的重要细菌病，2012年以前很少听说猪场有猪丹毒，但2012年以后，猪丹毒似乎死灰复燃，引起了很多猪场发病，甚至严重死亡。

体内有菌 正常猪的体内（主要在扁桃体）就携带猪丹毒杆菌，当猪群受到应激因素的影响，或发生免疫抑制性疾病（如蓝耳病、圆环病毒病等）的感染或发生霉菌毒素中毒等，猪的抵抗力下降，原本共生或隐性感染的细菌可大量繁殖，致病力升高，从而引发猪丹毒。

土壤的污染 土壤中的猪丹毒杆菌可以存活数年之久，在水淹的猪场，土壤中的细菌可能被冲出，进而扩大污染范围。同样，水源被污染，也可导致猪丹毒的感染范围扩大，引起重大损失。

疾病复杂程度高 由于猪场存在大量的致病菌，在水淹后，无论是下水道，还是土壤里隐匿的细菌都可能大量暴露出来，污染饮水、饲料和环境。曾经有个猪场，被水浸泡过后，剩余的猪发病率极高，即使频繁用药，也不能彻底控制。后来这个猪场就彻底清群，清洗、消毒，间隔半年后，重新进猪，基本上没有什么重大疾病了。

水淹后猪场杂病或混合感染的机会增多

隐性感染或共生菌致病 普通猪场的猪没有SPF或无菌猪，在体内（包括肠道、呼吸道和泌尿生殖道等）有很多的细菌，如链球菌、副猪嗜血杆菌、放线杆菌、葡萄球菌以及很多不常见的细菌，洪水造成猪抵抗力下降后，这些细菌可乘机大量繁殖，通过不同途径进入非常规寄生部位，从而引起严重的疾病。由于很难确定具体引起发病的细菌，大量用药、联合用药也往往无济于事。无论腹泻、呼吸道疾病，还是繁殖障碍以及全身感染，都难以用药物短时间内控制。

水淹猪场如果问题很大，最好清空猪场，并做好清洁和消毒工作。

清群 是指将猪场所有的猪都转移到别处或者销售，不留一头猪。因为留下的猪可能成为重要的传染源，成为猪场的隐患。

清洁和消毒 当清空猪场、猪舍后，需要彻底清理杂物、淤泥、饲料以及所有不能用于养猪的物品。修不好水损设施，保持排污管道的畅通。高压冲洗猪舍、猪栏、附属设施、所有硬化的道路等。病死猪处理设施以及粪污处理设施应重点冲洗。冲洗彻底并干燥后需要喷雾消毒，可选择过单硫酸氢钾复合盐（如卫净美）1:200稀释后喷雾消毒，按50ml/m2使用。该产品具有三重消毒作用，氧化、氯化和酸化等，有机物的影响小，杀毒谱超广。也可以选择戊二醛、二氧化氯、二氯异氰尿酸钠/三氯异氰尿酸、碘酸等广谱消毒药，具体用量需要参考使用说明书。最好间隔5~7天，更换消毒药，重新消毒一次。

检测 彻底消毒干燥后，需要对猪舍地面、猪栏、料槽、水槽、环境、附属设施等采样进行病毒（特别是非瘟病毒）检测和细菌培养，若达不到猪场卫生标准，则需要重新清洁和消毒。

若猪场水淹的不厉害，不一定要彻底清群，主要清理水淹的猪舍，这些猪最好转移或销售，不要与其他猪混群饲养。对其局部和水浸的其他区域进行清理和消毒。没有太大问题的猪舍，可行带猪消毒。

防霉变 在雨水丰盛的季节，空气湿度大，饲料及原料更容易发生霉变。因此，需要认真检查猪场剩余的饲料或原料，如有霉变，应立即停用，还需要检查湿度，若湿度大，霉变的风险更大。可酌情增加饲料中防霉剂和霉菌毒素吸附剂的用量。

提高抵抗力 高温、高湿和水淹本身是非常强的应激反应，所以饲料中最好增加维生素和微量元素的添加量。同时可添加具有提高猪抵抗力的添加剂或中药制剂。

饲料给药 因为在水淹猪场，杂病比较多，而且很难短时间内对所有病例进行准确诊断和对致病菌进行鉴定，需要采取群体用药的办法，对保育、育肥和种猪进行药物防治。可在每吨饲料中添加妙可美（80%延胡索酸泰妙菌素预混剂）150g+力多美欣（50%盐酸多西环素）250g+福可欣（20%氟苯尼考粉）200g，连用7~10天（氟苯尼考的用量对胚胎没有影响）。哺乳仔猪可注射赛菲欣（10%头孢噻呋），1ml/20kg体重，或0.2~0.5ml/头（注射1次，7天有效）。

饮水给药 有条件的猪场，可以选择饮水给药，选择广谱的抗菌药物，如安力素（30%、50%和80%阿莫西林可溶性粉）按纯粉计，每吨饮水添加80g，连用5天（可将全天的用量添加到4~6小时的饮水中）。

驱虫 洪水退去后，需要驱虫一次，包括外寄生虫和内寄生虫，因为水可以将寄生虫卵带到任何一个地方。

针对猪丹毒 猪丹毒的首选药物是青霉素，5万单位/kg体重，每天至少注射3次。而群体用药首选阿莫西林，可选择80%安力素，每吨饮水添加120g，连用3~5天，可将全天的用量添加到4~6小时的饮水中。

若使用的地表水、地下水，需要加强消毒，可用二氧化氯、单过硫酸氢钾复合盐等。