例如，尽管美国对两种获批的家禽氟喹诺酮类产品的使用施加了若干限制，但最近从20%的国内零售鸡肉产品样本中分离出了耐环丙沙星的弯曲杆菌。分子分型揭示了来自鸡肉产品的耐药空肠弯曲杆菌菌株与来自国内获得性人类弯曲菌病病例的空肠弯曲杆菌菌株之间的关联。1998年国家抗生素耐药性监测系统年度报告-肠细菌（NARMS）报告，13.3%的人类弯曲杆菌分离株对环丙沙星耐药。1999年的初步数据显示耐药性增加到20.5%。荷兰、英国和西班牙也注意到耐环丙沙星弯曲杆菌与批准氟喹诺酮类药物用于食用动物之间的时间关系。

同样，已注意到在肠炎沙门氏菌血清型鼠伤寒沙门氏菌确定型104（DT104）中氟喹诺酮类药物敏感性降低与英国批准和使用氟喹诺酮类药物用于兽医治疗之间存在时间相关性。在美国，由DT104引起的人类疾病与食用未经巴氏消毒的乳制品和与家畜直接接触有关。NARMS已经在美国发现了少量对环丙沙星敏感性降低的人类沙门氏菌分离株。虽然数量很少，但根据最低抑菌浓度等于或大于0.25mg/ml的沙门氏菌分离株的百分比测量，对环丙沙星敏感性降低的趋势令人担忧。沙门氏菌分离株的百分比从1996年的0.4%上升到1997年的0.6%，1998年的0.7%和1999年的1%。

NARMS还检测从几种动物身上分离的沙门氏菌和弯曲杆菌。分离株来自诊断实验室、农场的健康动物以及屠宰场或加工厂收集的原料产品。对分离的沙门氏菌进行了对17种抗生素的敏感性测试，对分离的弯曲杆菌进行了对8种抗生素的耐药性测试。1998年，沙门氏菌分离株最常见的耐药性是四环素（占分离株的38%）、磺胺甲新唑（32%）、链霉素（35%）、氨苄西林（18%）、替卡西林（17%）、卡那霉素（15%）和庆大霉素（11%）。弯曲菌对四环素（60%）、萘啶酸（16%）、环丙沙星（11%）、克林霉素（7%）、阿奇霉素（6%）和红霉素（6%）的耐药最为常见。对多种抗生素的耐药性是一个问题。

随着生物体对更多抗生素产生耐药性，治疗问题变得更加复杂。1998年，40%的动物沙门氏菌分离株对2种或更多种抗生素具有耐药性。这比1997年的25%有所增加。1998年，18%的人对5种或5种以上抗生素具有耐药性，而1997年这一比例为11%。

不幸的是，没有一个检测动物病原体耐药性的国家监测系统，因此我们无法跟踪和报告趋势。